تناول قصة الفلم هذه المرة مهمة أعادة شخص يدعا" موكاد" نينجا مفقود وهو يحاول تنفيذ تقنية محرمة ، تعود به إلى الماضي، فيطارده ناروتو و فريقه وأثناء ذلك يتم تحريك هذه القوة الغريبة فتحيط ناروتو بضوء وعندما أنقشع الضوء ينتهي بهم الامر عائدين إلي الماضي 20 سنة ،، ومن ثم سيقابل والده ، ثم تبدأ المغامرة الرائعة بطريقه غربيه لايعرفون سببها وسيحدث الكثير من الاشياء المثيرة.