تبدأ القصة عند ريو وهو يتدرب في الليل كالعادة الا أنه يشعر بشعور غريب مما يجعله يصبح شريرا ويخرج عن وعيه وذلك بسبب طاقة الظلام \"دارك هادو\" الذي يتحكم بها أكوما, يرجع كين الى اليابان ليلتقي صديقه القديم ريو بعد وفاة مدربه غوكن ولكي يزور قبره, وكالعادة يتدرب الصديقان مثل الأيام الماضية الا أنهما يتقابلون مع الولد الذي يدعي نفسه أنه أخو ريو المفقود ويدعى شن, يطلب شن من ريو أن يدربه ويحاول التقرب منه ليصبح مقاتلا قويا مثل ريو ، ومن ناحية أخرى بدأ الدكتور سادلر بتنفيذ مخططاته الشريرة